1646年，他甚至发了疯一样的发动了对乌兹别克汗国的战争，先后夺取了乌兹别克汗国在阿富汗北部的巴达赫尚和巴尔赫，随后他又派自己的三子奥朗则布继续统军北进，进入了荒凉的中亚山区和草原——沙.贾汗的目标是自己祖先在中亚的故土撒马尔罕和布哈拉。

不过这场战争最后还在1648年时因为陷入僵持而无法维持后勤供应，而遭受惨败。

随后，伊朗的萨法维王朝趁机反攻，在印度蒙古帝国新败之际夺回了坎