站在朱家皇帝的角度，他肯定是想要保住这些世袭武职的。

但站在一个身处大航海时代的汉人皇帝， 他又必须尽快，提升军队的侵略性和战斗力，这就要提拔一大批有能力的将校。

一方面是要保证军队的忠诚性，一方面又要保证军队的战斗力，这就需要从中寻到一个平衡点。

至于说后世的双主官（懂的都懂）制度，朱由检也想过，但很快就被他给否决了