昆明舰离开青岛以后，华东政府也没有闲着，而是继续进行混合舰队的组织工作。另外的工作就是在外交方面，就在昆明舰驶离青岛的时候，华东政府的北京办事处就向荷兰驻清廷公使克罗伯(M. F. M. Knobel) 递交了华东政府的交涉信，指责荷兰巴达维亚殖民当局放纵爪哇的当地土著，发动了排华行动，造成大量爪哇华人的伤亡和财产损失，并要求荷兰政府立刻干涉，责令巴达维亚殖民当局立刻釆取有效措施，恢复爪哇