碇真嗣现在的问题就是父母的不和的问题，他们的目标相差太远了，碇唯惦记的不是自己的幸福，而是全人类的机会。而碇源堂就想着自己，连儿子都顾不上。

由《人类补完计划》衍生出来的三大派系，一seele为引导的补完派，二以碇唯为核心的选择改良派，三碇源堂的篡夺派。当然后来还有以葛城美里为核心的反对派，她想要阻止补完计划，维持现状。

一个计划就能衍生出四个不同的选择，可以说是君子和