及的方面极多，方运决定把《瘟疫论》分成上下两卷。把所有对瘟疫之主无用的部分都分到下卷，等以后完善，而把所有能克制瘟疫之力的医道知识归在上卷，更容易成书。

除此之外，新的《瘟疫论》不仅有吴有性的原作内容，还添加了后世许多医术大家的理论和验方，同时掺杂医圣张仲景以及圣元大陆医家现有体系的知识，保证《瘟疫论》不是凭空想象出来，而是有着坚实的基础。

方运没有立即书写《瘟疫论》，而是在奇