担负起长子的职责。恰在这时，徐州动乱初现端倪，诸葛玄就想带着家人，前去相对比较安定的荆州，依附旧友刘表。就是这个时候，诸葛以自己已经成年为由，委婉的拒绝了诸葛玄一起前往荆州的建议，只是让自己的弟弟妹妹随诸葛玄而去，自己则是带着继母南下，目的地正是江东。毕竟江东虽然之前还在战乱，但江东三郡被刘风统一的消息，诸葛瑾还是知道的。

但就在路上，他遇到曹操南下的事情，不得已随着流民队伍，涌入彭城。