万历十五年在国内整整出版四十年，创下了史学读物很难企及的近六百万册的销售纪录，成为历久弥新的一个奇特出版现象。

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不过，《万历十五年这部书还是有些缺憾的。

一是黄仁宇的资料未必齐全，而且他本身也并非历史系出身。他在大学学得是机电系，之后又投笔从戎，三十二岁才开始攻读历史，而且还是在美国学习中国史，自然难免走偏。

因此他的史料处理极不严谨，对他有利的便用，