检于关津，扼要道，察奸伪，期在士民乐业，商旅无艰。”由此不难看出，关津、要冲之处，是设置巡检司的主要地点，到后来矿山、商贾辐辏之地、民族交错地方、州县交边区域、距治所遥远之地、流民往来集聚之处也先后设立。

巡检司的主要任务是盘查过往行人，同时担负着稽查无路引外出之人，缉拿奸细、截获脱逃军人及囚犯，打击走私，维护正常的商旅往来等责任。

不过，巡检司的兵丁并非是正规军，而类似于乡勇