是自宇多天皇以来一百七十年间唯一和藤原氏没有直接血统关系的天皇，他自幼就和生母一起备受藤原氏的欺压，即便是成为太子后的二十多年里地位也并不稳固，所以后三条天皇不愿再充当藤原家族的傀儡，即位后即致力于恢复已中断一个世纪的天皇亲政，于是他改革宫廷的礼仪制度，减少宫廷费用，没收未经天皇颁发地契的土地。从而使得反藤原的各种势力集合在他的周围。

后三条天皇打破门阀限制，起用地位较低的中下层贵族参与