迅速开始带领军团部人员对长沙进行全面考虑，以做出最完善的防御方案。

1939年五月二十一日，也就是在委员长离开长沙的第二天，军事委员会正式下达整编命令，孙卫国第六军团整编为新编第六军。

新编第六军下辖荣誉第三师，201师两个师部队，孙卫国担任新编第六军中将军长。

按照军委会命令，荣誉第三师为步兵师，201师为装甲师，这两个师编制军委会不会干预，全部由孙卫国拟定。