因为军委会动作非常快，所以部队在九州岛的行动很成功。九州大部分藩主都加入了萨摩藩领导的九州联军，根本没想到远东会对她们发动攻击。而且还是丧心病狂的斩草除根，整个九州的大名藩主，除了萨摩藩的岛津家，其余的大名都被铲除的一干二净。

经过近一个月的扫荡整肃行动，远东用铁血的政策，让九州岛各地的治安逐渐好转。这期间大名藩主和她们的家眷，以及他们的家臣武士，不是在战场上斩杀殆尽，就是被军委