的士绅官僚、藩王勋贵不断霸占各地军屯的耕地，再加上各地卫所军户怠耕、逃亡和武装反抗，造成的大量土地被抛弃，使得大明各地的军屯耕地屯田的面积不断的减少，各级军头把军屯耕地变成了自己的私人土地，使得军屯耕地的数量依然达到了数十万顷。

公司进入中原以后，虽然没有触动各地士绅阶层的利益，但是大明各地的卫所属于军事单位，所以公司就没有那么客气了。

派出远东军对大明各地的卫所进行强制接收，