总参谋部在海南岛安排了2艘兰芳级战列舰和2艘兰芳级战列巡洋舰，以海军陆战队的1个师为先头登陆部队，以驻扎崖州的1个军为主做战部队，从菲律宾的北部发动对攻击；群岛军区的1个军步兵以及海军已经全部集中到万鸦老，准备从菲律宾的南部发动攻击。

群岛军区为了更好的维持占领区的治安，还单独组织了8个团的土著雇佣军，这些人对棉兰老岛以及吕宋岛上的土著有相同的语言与血统，更方便与菲律宾土著交流；