他的研究工作涉及数学的诸多领域，其主要成就表现在拓扑学和数学机械化两个领域。他为拓扑学做了奠基性的工作；他的示性类和示嵌类研究被国际数学界称为“吴公式”，“吴示性类”，“吴示嵌类”，至今仍被国际同行广泛引用。

吴文君觉得自己活到98岁才作古，已经很满足了。家庭和个人成就也没有什么遗憾的地方。唯一让他觉得不舍得便是自己从事了一辈子的数学研究事业。

不过，在过去的几十年