寻常内功心法走的多是聚气丹田，然后逐一冲破经络上的各处穴道，最终连点成线的路子，但混元神功不是，虽然通过吐纳得来的灵气也会率先进入丹田气海，却不是自丹田气海聚集积攒，而是自丹田之中略做中转，随后分赴十二正经。

练气的要诀都是以意行气，但初练之人体内无有丝毫灵气，以意行气也就无从谈起，但哪怕呼吸吐纳所得来的灵气微乎其微，也要自心中一遍遍的控制并不存在的灵气游走十二正经。