教渗透入叶尔羌汗国，并且与汗国的上层产生了千丝万缕的联系，甚至已经影响了汗国的走向。

当年乌兹别克昔班尼汗率部大举南下，东察合台汗国马合木汗战死，幼子赛依德被擒，长子满速尔汗在吐鲁番继位。

赛依德在河中地区历经辗转，最后在巴布尔汗的支持下，建立自己的军队，并打败盘踞在喀什噶尔附近的杜格拉特人首领阿巴拜克，建立以喀什噶尔、叶尔羌、于阗、英吉莎、阿克苏、乌什六城为中心的叶尔羌汗国。