但是随着第一次明宋战争的爆发和江南西路的匪患爆发，十二支主力部队当中，唯有川蜀战区的三支主力部队尚且完好无损。

明宋战争之中，南宋江淮战区和临安禁军六支部队遭到了明军的毁灭性打击。

建康府大军和镇江府大军几乎全军覆灭，只有池州大军尚且保存完整编制。

殿前司大军和侍卫马军、步军司差不多十万兵力损失一大半，后面只有四万人保存下来，成为了如今的殿前司。