殷正茂早年其实是以不畏权贵、正直敢言的形象在朝廷中头角初露，引起内阁注意的。所以不久后，就被外放锻炼，历任广西、云南、湖广兵备副使，再迁江西按察使。

因为早年颇有正直敢言的美名，当时殷正茂与张居正这位同年的关系还算不错，不说相交甚厚，至少也是关系亲近。后来张居正得徐阶所独重，竟而由翰林学士直接入阁，殷正茂便更是经常与张居正书函往返，说是政治盟友并不为过