朵颜三卫的消失，使得整个蓟辽的局势出现了巨大的变化。在原本的大明军事战略定位中，辽东地区的职责是在北直隶地区遭到蒙古军事进攻的时候，起到牵制作用的，也就是明人所说的“拱卫京师”。

然而，伴随着朵颜三卫的覆灭，以及察哈尔部的到来，整个直隶和辽东地区的军事压力骤然提升，因此原本的辽东军事部署，不得不向受到军事威胁最大的辽西地区收缩，而原本在建州地区的大