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从永乐年间开始，明朝的漕运工作就基本由运河承担了，具体负责这项工作的是水军，也叫漕军，由陈瑄担任漕运总兵。但明朝的文官集团向来不允许军人获得太多权力，于是又多了个漕运总督，由文官担任。

两百年间，有时候总兵比总督权力大，有时候又是总督压着总兵，具体谁强谁弱要看当时皇帝的态度，还有官员们自己的能力。

目前的漕运总兵叫王承勋，世袭新建伯，担任漕运总兵已有十