有明一代，大明的学脉可以看成两个派系，一个是南方的阳明之学，另外一个就是北方的薛瑄朱学，足见薛瑄在学术上影响之巨。

令人津津乐道的是，薛瑄与大明的其他醉心于科举的世子不同，薛瑄考科举更多的是出于无奈和被动。

薛瑄的父亲薛贞在地方县衙任儒学教谕多年，当薛贞担任河南鄢陵县教谕时薛瑄已近而立之年，但仍然随父亲求学，研读程朱理学，并泛及子史百家、天文地理等，对科举之事并不感