登州府城内。这是登莱总兵的设置由来。但是，到了崇祯二年（1629年），为了节省费用开支，登州总镇又被裁撤。到崇祯七年（1634年），山东的局势逐渐紧张，又不得不复设登州总镇。登莱总兵，就是专门管辖登州总镇军务的。

永乐至宣德年间，为了增强海防军队的机动能力，必要时全力增援警急地段，朝廷先后在登州、文登、即墨设立了相对独立的海防机动部队，这就是号称海防三营的登州营、文州营和即墨营。