二层以上，便是一些大儒墨客的偏好。这里酒水价格要比一层高上两三倍，尤其是这一层，还有许多弹琴伴舞的小娘，整日里笙歌艳舞，好不热闹。

相对的来说，到凌云阁三层的客人便会偏少一些。三层均为包房，每间包房根据大小不同，摆放着数量不等的矮桌。

包房内有瑶琴、围棋以及上好的美酒。这里没有舞娘伴舞助兴，客人来此，多是自身通些音律和博弈之道，是处绝佳的以文雅会天下之友的去处。