久，在织田家族部将羽柴秀吉的劝诱下，来岛村上家族当代家督村上通总反出毛利家族改投织田家族；此事使毛利家族陷入惊慌，毛利家族在与因岛、能岛两村上家族再度重申盟约后联合出兵声讨来岛村上家族，并于六月份对来岛村上家族本城来岛城发动了总攻击。

在村上武吉的猛烈进攻下，来岛城失陷，村上通总匆忙逃往京都投向羽柴秀吉，之后羽柴秀吉让他改以居地为姓，易名来岛通总，落入毛利家族掌握的来岛城则被赐为村上