下辖八大水警局。

分别为那霸水警局，基隆水警局，澎湖水警局，香港水警局，三亚水警局，占城水警局，吕宋水警局和三屿水警局。每个水警局各设一支地方分舰队。其首要目的是控制西方与大明的东西两条贸易航线。

一条是从福建出发，沿大明东南海岸、绕中南半岛，最后抵达马六甲。

另一条是自琉球出发，经台湾东部南下吕宋，沿苏禄、渤泥、至爪哇、苏门答腊、马六甲。

隆庆开关的旨意中