造成很多城市环境脏乱，蝇蚋杂生，污水横流，这是明末各地连连发生大疫的原因之一。

王斗治下还好，但临近的山西、陕西各城就垃圾成堆，臭气冲天，但因为防疫局组织得力，而且拿出大笔的经费发动民众，这有钱拿又关乎身家性命，在大扫除这方面民众倒非常踊跃。

不过疫情仍然来势凶猛，应州发现疫情后，每天死亡人数达到三百多人，而且传播非常迅速，主要就是隔离困难。