到了两晋南北朝，诸子百家渐渐有所缓和，元气略微有所恢复。

刘徽、祖冲之、郦道元、贾思勰、范缜、马钧、葛洪、裴秀、王叔和……许许多多或是自然科学的先驱、或是先进思想的缔造者，在这个时期喷涌而出，璀璨夺目，留下了层出不穷的传世名著。

然而，乱世促进诸子百家的兴盛，这是因为统治者无力打压，当隋朝一统南北、大唐匡扶宇内，盛世太平，皇权集中，儒家便因为其