官吏前往西域四个郡任职之外，还对西域军区的驻军进行了一波新的分配。

考虑到战略防御的需求，刘备决定把西域都护府本部安排在大宛郡内，西域都护张飞就率领两个军的兵力驻守大宛郡，以加强对大宛郡的治理，并且小心防范外部的康居国和贵霜帝国。

另一边，在龟兹国、原西域都护府驻地设立西域都护府第二驻地，以西域长史赵云驻扎于此，居中策应张飞。

西域军区现有的六个军，除两个军安排在大宛