是分权，并没有权责上的限制。

五军都督府有统兵权，却无调兵权。一旦国家用兵，是由兵部下发调兵文移，从各卫所抽调战兵，指派总兵官为将。所以兵部有调兵遣将之权，但本身手里是没有兵的。

同时为了做到军事保密，五军都督府下辖的军户丁口，从不报备兵部知道。明朝的兵部尚书，根本不知道国内有多少卫所兵。而五军都督府掌握在固定几家勋戚手中，时日一久便盘根错节，又有上下其手的空间，最终导致卫所屯