，艾吉奥受了伤，金苹果也被夺走。

艾吉奥回到弗洛伦萨，成功夺回苹果。随着艾吉奥收集的阿泰尔密函越来越多，刺客组织也从中拼出了一个世界地图并通过苹果找到了更多的神秘地点。艾吉奥为了进入地下密室，独自闯入西斯廷教堂，击败了教宗亚历山大六世并打开地下室的隐藏通道，从先行者口中得知了人类在未来将会面临重大灾难的预言。

艾吉奥和叔叔马里奥回到了蒙特里久尼，但这里再度遭到圣殿骑士的攻击，叔